第643章 五十九号实验

需要的关键数据不出来，小白鼠基因功能演化模拟就无法继续进行，曾凡也不好整天去各个小组催促，就像理查德所说，有些实验着急也没用，必须要有耐心。 习惯了忙碌的状态，偶然清闲下来，曾凡总会有无所适从的感觉。 从实验室出来，他决定去贝拉农场，自己的实验室，想做什么自由度更高。 他们的新型超算出乎意料的受欢迎，加上贝拉农场的实验室进行噬菌体和酵母菌的研究对算力要求不太大，细胞一号就没有进行升级，准备等基因二号芯片出来后直接升级更高算力。 除了以噬菌体为基因载体进行杀菌研究外，布莱顿和黛西也在研究探索更好的对基因进行编辑的方法，现有的手段太过复杂繁琐，成功率还很低，改造一个最简单的rna片段都费尽周折，更别说编辑复杂千万倍的基因序列了。 他们目前能使用的方法太过简陋，好像用公元前的冶铁方式，想要建造一艘万吨巨轮一样，简直就是痴心妄想。 曾凡开着野马直接到了实验室楼下，实验室共有七层，顶层是超算机房，布莱顿的实验室和办公室都在在二楼。 进入他办公室的时候，布莱顿正坐在办公桌前的椅子上，面对着窗台上一盆仙人掌在发呆，乱糟糟的头发和胡子不知道多久没有打理了。 “布莱顿教授，有什么进展吗？”曾凡拉过一把椅子，坐在他的办公桌旁边。 “没有，我们的设想很好，理论上面也没问题，只是目前还没有找到正确的方式，不知道什么时候能成功！”布莱顿对他到来一点也不奇怪，继续盯着仙人掌发呆。 曾凡的设想就是改造出一种噬菌体，作为基因剪刀，利用它们的自有能力，携带指定的基因片段，插入想要编辑的目标基因组中。 噬菌体按照对细菌的杀伤力分为毒性噬菌体和温和型噬菌体，毒性噬菌体进入所克制的细菌体内就会疯狂的自我复制，达到一定数量就会分解一种酶，裂解宿主细菌；温和型噬菌体不同，进入宿主细菌后，会将自身基因整合到细菌染色体上，跟随细菌一起繁殖，在达到某些特定条件才会裂解宿主细菌，重新寻找宿主。 他们的设想就是利用这种温和型噬菌体的特性，进行基因插入，从而实现对目标基因组的编辑。 可是噬菌体都是专门针对某一类细菌进行入侵，体型太小，想将固定基因和它们融合也很难，尤其是后面一个难点，布莱顿研究半年也没找到一个好办法。 面前的桌子上放着厚厚一摞文件夹，曾凡随手拿起最上面一本翻看，是一本实验记录。 布莱顿的一个助手进行的一次新型噬菌体实验，他们在研究一种针对蓝莓树致病细菌的噬菌体，这次实验以失败告终，这种噬菌体入侵目标细菌后并不能大量繁殖，反而是肉包子打狗，有去无回。 在显微镜下的观察显示，这些噬菌体进入目标细菌后，自身基因被某种物质切断，等于被人家打了埋伏，一进去就被消灭掉了。 尤其是电镜拍摄的照片显示，噬菌体的碱基序列被切断的位置非常整齐，都在某一个固定的位置被切断，好像是一群被斩首示众的土匪。 “布莱顿教授，这次实验前在细胞一号上面进行过模拟验证吗？”曾凡将实验记录放到他面前问道。 “这是临时增加的实验，没有进行验证，不过我们做过这种病菌的基因组测序，进行验证难度不大，这报告有什么不对吗？”布莱顿问道。 “病菌能将噬菌体基因在同一位置切断，那么它们应该有方法判断噬菌体的基因序列，然后才好下刀，这不正是我们需要的剪刀吗？” 他的话瞬间引起布莱顿的兴趣，拿起文件夹仔细观察那些拍摄的照片，越看越觉得曾凡说的有道理，然后拿着文件夹急匆匆跑了出去。 “瑞恩！瑞恩！五十九号实验的样品还在吗？”布莱顿出门跑到不远的一间实验室喊道。 “教授，刚刚处理完！”一头棕色自然卷发型的年轻助手耸耸肩回答道。 “那你重新准备材料，重复这个实验，最后的照片多拍几张，看看结果是不是相同！”布莱顿吩咐道。 “遵命，先生！” 随后，布莱顿拉着曾凡乘电梯上顶楼的机房，准备进行一次这个实验的演化模拟，看看能不能复现实验中的情况。 机房中一身白大褂的黛西正坐在超算控制台前面观看屏幕上的模拟画面，整天观看类似画面的曾凡一眼就看出这是什么场景。 这是细胞分裂的场景，她们不是一直在研究病菌和噬菌体吗，怎么研究起多细胞生物了，曾凡有点纳闷，这种演化模拟都很费时间。 “黛西，你的牛皮蝇模拟还要多长时间？我们要做五十九号实验演化模拟！”布莱顿拉开椅子坐在她身边。 “我也不知道，才刚开始一天，还在胚胎发育期，我可以暂停让给你先做！”黛西转头看见曾凡站在身后，笑着打招呼。 “曾，你可是有一个月没过来了！我们的细胞一号什么时候升级？” “基因二号芯片量产出来就升级，下个月应该差不多了，我们实验室当然要拥有最强超算！”曾凡回答道。 毕业于普林斯顿的黛西今年三十二岁，留校当了三年助教，去年评副教授失败，经过帕米拉的介绍来到贝拉农场实验室，继续自己的研究。 曾凡将黛西当前的模拟程序暂停存盘，然后根据布莱顿的提示操作调出实验菌的基因组序列，使用工具软件进行演化程序制作。 为了方便他们进行不同菌种的演化模拟，曾凡专门改写了个工具软件，只要有细菌或者噬菌体的基因组序列，就能根据已知数据自动生成模拟程序，极大的降低了他们自己操作的难度。 曾凡没时间总在这里，薛燕开学后也只有周末能过来，有了这个工具软件，他们就方便多了，每次实验前先进行几次模拟，效率能提高很多。 “黛西，你这个模拟程序也是用工具软件自动生成的吗？”曾凡好奇的问，这个软件是在之前的基础上进行了专门对细菌微生物的优化，牛皮蝇这种他见都没见过的物种不知道准确度能有多少。 “是啊，你写的工具软件挺好用，这么复杂的昆虫一个多小时程序就完成了，我添加了一些特征参数就开始演化模拟，今天一整天都没有出错，可能有你之前果蝇的模拟的数据积累吧，毕竟都是蝇类！”黛西说道。 细菌类单细胞生物基因组都很简单，生成速度很快，几分钟就完成了，立刻开始演化模拟。